Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms