Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01648 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01648 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01648 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01648 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms