Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01644 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01644 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01644 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01644 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01644 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01644 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01644 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01644 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01644 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01644 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01644 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms