Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl20O89093 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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