Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms