Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ShdO88834 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ShdO88834 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms