Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcn3O88705 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.3 ms