Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Dnmt3bO88509 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dnmt3bO88509 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dnmt3bO88509 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dnmt3bO88509 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dnmt3bO88509 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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