Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AurkcO88445 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AurkcO88445 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AurkcO88445 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AurkcO88445 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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