Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd46O88174 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd46O88174 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cd46O88174 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cd46O88174 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cd46O88174 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms