Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtssO70370 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtssO70370 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtssO70370 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtssO70370 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtssO70370 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtssO70370 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtssO70370 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtssO70370 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtssO70370 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtssO70370 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtssO70370 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtssO70370 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtssO70370 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtssO70370 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtssO70370 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtssO70370 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtssO70370 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtssO70370 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtssO70370 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtssO70370 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms