Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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Lnx1O70263 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lnx1O70263 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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