Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms