Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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