Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms