Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlkO54988 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlkO54988 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlkO54988 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlkO54988 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SlkO54988 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms