Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LatO54957 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LatO54957 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LatO54957 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LatO54957 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LatO54957 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LatO54957 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LatO54957 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LatO54957 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LatO54957 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LatO54957 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LatO54957 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LatO54957 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LatO54957 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LatO54957 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LatO54957 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LatO54957 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LatO54957 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LatO54957 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LatO54957 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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