Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms