Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TsksO54887 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TsksO54887 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TsksO54887 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TsksO54887 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TsksO54887 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TsksO54887 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TsksO54887 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TsksO54887 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TsksO54887 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TsksO54887 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TsksO54887 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TsksO54887 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TsksO54887 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TsksO54887 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms