Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms