Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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