Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Clk2O35491 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Clk2O35491 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Clk2O35491 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Clk2O35491 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Clk2O35491 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Clk2O35491 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Clk2O35491 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Clk2O35491 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Clk2O35491 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Clk2O35491 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Clk2O35491 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Clk2O35491 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk2O35491 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms