Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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