Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms