Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd2O35392 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms