Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkd2O35245 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Pkd2O35245 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd2O35245 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
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