Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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