Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms