Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna2d1O08532 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms