Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm6871L7N248 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm6871L7N248 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm6871L7N248 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm6871L7N248 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm6871L7N248 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm6871L7N248 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm6871L7N248 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm6871L7N248 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm6871L7N248 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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