Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms