Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm2888K7N746 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2888K7N746 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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