Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3248K7N721 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms