Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3542K7N6U2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms