Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm5225J3QPL3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms