Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc180J3QNE4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms