Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21972J3QN38 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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