Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3415J3QMS8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms