Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20873J3QMQ9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms