Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms