Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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Cldn34c3J3QJW5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn34c3J3QJW5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn34c3J3QJW5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn34c3J3QJW5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn34c3J3QJW5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn34c3J3QJW5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn34c3J3QJW5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn34c3J3QJW5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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Cldn34c3J3QJW5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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