Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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