Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21818J3KMS6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21818J3KMS6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21818J3KMS6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21818J3KMS6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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