Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm21897J3KMP5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm21897J3KMP5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm21897J3KMP5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm21897J3KMP5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm21897J3KMP5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm21897J3KMP5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm21897J3KMP5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21897J3KMP5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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