Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm20830J3KML6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm20830J3KML6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm20830J3KML6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm20830J3KML6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm20830J3KML6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm20830J3KML6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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