Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29394H3BIW7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms