Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms