Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn2r85G3UW56 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn2r85G3UW56 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms