Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp32F8VPZ3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms