Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28038F7BCN9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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